Метагеномное ассоциативное исследование прогрессирования заболевания ВИЧ у ВИЧ-контроллеров

Контроллеры ВИЧ — это исключительная подгруппа людей, которые способны естественным образом контролировать репликацию ВИЧ при отсутствии антиретровирусной терапии. Естественный контроль ВИЧ-инфекции считается сложным состоянием, в котором генетические факторы хозяина могут играть ключевую роль. Однако последующие исследования показали, что у некоторых из этих субъектов наблюдалось клиническое, иммунологическое и вирусологическое прогрессирование. Исследование опубликовано в журнале Lancet.

pic
Фото: РИА Новости/ Юлия Винокурова

С точки зрения иммунологических прогрессии у ВИЧ-контроллеров, в потере СD4+ Т-клеток участвуют различные иммунологические факторы, такие как нарушение гомеостаза Т-клеток, активацией Т-клеток будучи одним из основных предложенных механизмов. В отношении генетических факторов, вовлеченных в этот конкретный фенотип, данные скудны. Выявление биологических маркеров ВИЧ-1-контроллеров, которые подвержены риску прогрессирования заболевания ВИЧ-1, определяемого снижением количества CD4 + T-клеток, является важной задачей. В данном исследовании был проведен анализ генетических детерминант на уровне ассоциаций всего генома, связанных с фенотипом LTNP-C у ВИЧ-контроллеров. В исследовании приняли участие 443 и 120 человек из Международной когорты контролёров ВИЧ (ICSC) и Швейцарской когорты ВИЧ (SHCS) соответственно критериям включения. 

Исследование показывает, что те генетические факторы, которые ранее ассоциировались со спонтанным контролем ВИЧ в общей популяции ВИЧ-контролеров, по-видимому, также участвуют в долгосрочном поддержании CD4 + T-клеток у ВИЧ-контроллеров. Однако ни анализы ассоциаций с одним локусом, ни анализы ассоциаций на основе генов не дали статистически значимых результатов при установленных пороговых значениях.

В совокупности эти факты могут указывать на то, что негенетические факторы или взаимодействия генетической среды могут играть более важную роль в защите от потери CD4 + T-клеток у ВИЧ-контроллеров, чем генетические факторы. Были выявлены различия в вирусологических и иммунных факторах между субъектами с постоянным контролем вирусной репликации и контороллерами, утратившими вирусологический контроль.

Также следует отметить, что изменения были связаны с LOC285696 , также известным как антисмысловая РНК BASP1 1 ( BASP1-AS1 ). BASP1-AS1 регулирует экспрессию соседнего кодирующего гена BASP1 , который, по-видимому, участвует в дифференциации клеток Th17. Этот подтип Т-клеток CD4 + особенно восприимчив к ВИЧ-инфекции, и по этой причине эта субпопуляция, по-видимому, истощена у инфицированных людей, но не у элитных контроллеров.

Источник