Открытие эффективных стратегий быстрого дизайна иммуногенов для индукции широко нейтрализующих антител ВИЧ-1 (bnAbs) имеет решающее значение для разработки вакцины против ВИЧ-1 и других высоковариабельных вирусов. Работа опубликована в журнале Nature communications.
Разработка вакцины, нацеленной на быстро эволюционирующие патогены, такие как ВИЧ-1, требует индукции широко нейтрализующих антител (bnAbs) с консервативными паратопами и мутациями, а в некоторых случаях и с теми же тяжелыми цепями Ig. Текущий поиск модификаций иммуногенов методом проб и ошибок, которые улучшают отбор для определенных мутаций bnAb, неточен. Чтобы точно спроектировать иммуногены, усиливающие bnAb, были использованы моделирование молекулярной динамики для изучения состояний встречи, которые образуются, когда антитела сталкиваются с оболочкой ВИЧ-1 (Env). Картируя, как bnAbs используют состояния встречи для поиска своих связанных состояний, ученые идентифицировали мутации Env, которые, как прогнозируется, выбирают для определенных мутаций антител в двух линиях B-клеток ВИЧ-1 bnAb. Мутации Env кодируют усиление сродства антител и выбирают желаемые мутации антител in vivo.
Эти результаты демонстрируют подтверждение концепции, что иммуногены Env могут быть разработаны для прямого отбора специфических мутаций антител с точностью на уровне остатков путем вакцинации, тем самым демонстрируя осуществимость разработки последовательной вакцины против ВИЧ-1, индуцирующей bnAb.
