Генетическая характеристика гена tat ВИЧ-1 у вирусологически контролируемых стареющих людей с ВИЧ, получающих длительную антиретровирусную терапию

Несмотря на достижения в области антиретровирусной терапии (АРТ), которая снижает вирусную нагрузку до неопределяемых уровней и улучшает количество Т-клеток CD4, вирусная ликвидация не была достигнута из-за персистенции ВИЧ-1 в покоящихся Т-клетках CD4 + . Поэтому исследователи охарактеризовали ген tat , который необходим для репликации и патогенеза ВИЧ-1, у 20 вирусологически контролируемых стареющих людей с ВИЧ, находящихся на длительной АРТ и высоких количествах Т-клеток CD4 + , уделяя особое внимание пожилым людям. Работа опубликована в журнале AIDS Research and Human Retroviruses.

pic
Фото: РИА Новости/ Владимир Вяткин

Геномная ДНК мононуклеарных клеток периферической крови от ВИЧ + использовалась для амплификации гена tat с помощью полимеразной цепной реакции с последующим секвенированием нуклеотидов и анализом. Филогенетический анализ показал, что каждая последовательность tat ВИЧ + была ограничена своими собственными белками и хорошо отличалась от других последовательностей ВИЧ + . Более того, наблюдалась низкая степень вирусной гетерогенности и более низкие оценки генетического разнообразия в последовательностях tat этих людей , которые снижались с увеличением количества CD4 T-клеток у этих ВИЧ + . Большинство аминокислотных последовательностей, выведенных с помощью ВИЧ + Tat, показали неповрежденные открытые рамки считывания и сохранили важные функциональные домены для функций Tat, включая трансактивацию и ядерную локализацию. Кроме того, аминокислотные последовательности, выведенные с помощью Tat, показали вариацию в ранее охарактеризованных эпитопах цитотоксических Т-лимфоцитов (CTL), что предполагает наличие мутантов-ускользателей.

Следует отметить, что низкая степень генетической изменчивости и сохранение функциональных доменов и вариаций в эпитопах CTL были с особенностями последовательностей tat , которые могут способствовать вирусной персистенции у этих 20 стареющих людей с ВИЧ, получающих длительную АРТ.

Источник